Организация была создана в сентябре 1996 года на базе Архангельского регионального отделения общественной организации Молодежный союз юристов РФ. Но регистрация как самостоятельного юридического лица с организационно-правовой формой «общественная организация» состоялось 4 марта 1998 года.
Сейчас Центр занимается содействием созданию благоприятных условий для эффективного развития некоммерческих организаций Архангельской области.
Так например, осенью 2000 года был создан Попечительский совет Центра поддержки некоммерческих организаций «Гарант». За прошедшее время Попечительским советом за счет средств именного фонда «Компании «Полярное Сияние» проведены три этапа конкурса «Дети Архангельска», направленные на оказание помощи детям-инвалидам, сиротам и детям с тяжелыми формами заболеваний; конкурс «Город без границ», цель которого — содействие социальной реабилитации и адаптация людей, имеющих инвалидность.
За счет средств общего фонда Попечительского совета в 2001-2002 г.г. проведен конкурс «Свободное время», направленный на организацию свободного времени подростков, и конкурс «Разные поколения», целью которого было создать условия для оказания помощи пожилым людям силами учащихся школ.
Специалисты Центра «Гарант» участвовали в широком спектре семинаров для НКО проводимых в России и за рубежом, прошли подготовку по курсу «Тренинг для тренеров», имеют богатый опыт разработки и проведения собственных семинаров и тренингов для представителей некоммерческого сектора, специалистов муниципальных учреждений и бизнес компаний.