Распоряжение о назначении Сергея Викторовича на эту должность губернатор области Игорь Орлов подписал 25 декабря 2012 года. Однако приступил к выполнению обязанностей аграрного министра Сергей Шишов только в начале февраля.
До работы в областном правительстве Сергей Шишов возглавлял агрофирму «Вельская», но 13 декабря 2012 года решением Совета директоров ОАО «Агрофирма «Вельская» был отстранен от занимаемой должности.
