Официально музей был основан 15 мая 1962 года. С 1 января 1968 года учреждение получило государственный статус и стало филиалом Архангельского областного краеведческого музея. На сегодня его собрание насчитывает 14 тысяч экспонатов.
В связи с юбилейной датой в Пинеге проходит форум «Музейная сфера Пинежского района: проблемы и перспективы развития». В ходе работы форума представители сферы культуры и образования Пинежского района обсудят вопросы, связанные с устойчивым развитием музеев и их ролью в социально-экономическом контексте. В программе форума — также семинар «Современный дизайн выставочного пространства», «круглый стол», экскурсия по музею.
