Юрий Борисович работал с 2000 по 2005 г. председателем Совета директоров лесозавода. В течение нескольких лет был председателем совета ассоциации работодателей «Промышленники Поморья», настоящим лидером лесной общественности Архангельской области. Он свято верил, что договорившись о сотрудничестве, создав обстановку для конструктивной работы, лесопромышленники смогут вместе отстаивать интересы архангельского ЛПК.
В 2000 г. избран депутатом Архангельского городского Совета, а в 2005 г. — депутатом Архангельского областного Собрания четвертого созыва. 4 июля 2005 г. был убит выстрелами из огнестрельного оружия во дворе своего дома на улице Попова, 15 в Архангельске. Следствие связывало убийство с профессиональной деятельностью Медуницина. Похоронен в Архангельске на Кузнечевском кладбище.
19 апреля Юрию Борисовичу исполнилось бы 54 года.